sábado, 28 de abril de 2012

Tránsito de energía en la célula: ATP y NADH


Todos los procesos metabólicos que hemos estudiado, hemos mencionado varios tipos de sistemas de transferencia de energía. Vamos a analizar las moléculas usadas por los organismos para mediar en estas transferencias. Unas de ellas aprovecharán la energía de los enlaces fosfatos, otros transportarán energía indirectamente a modo de poder reductor.

ATP.

Veamos la estructura del ATP.
ATP
Esta molécula corresponde al ATP4-. Como indicamos, las cargas negativas se saturan con Mg2+ o con Mn2+. La forma ionizada es la que aparece en condiciones normales, a pH 7.

ATP y fosforilaciones.

La energía que utiliza el ATP es la que se guarda en los enlaces anhidrofosfóricos.
En cuanto a la energía de enlace:

ATP + H2O ADP + Pi - ΔGº = -7,3 Kcal/mol
ATP + H2O AMP + PPi - ΔGº = -7,3 Kcal/mol
ADP + H2O AMP + Pi - ΔGº = -7,3 Kcal/mol
PPi + H2O Pi + Pi - ΔGº = -7,3 Kcal/mol
AMP + H2O Adenosina + Pi - ΔGº = -3,4 Kcal/mol

La razón de la variación de energía alta en el ATP parece que radica en la abundancia de cargas. Cuando se hidroliza el ATP disminuyen las cargas, hay un alivio. Estamos trabajando en condiciones de estado:


En realidad, la ΔG vendría dada por la siguiente ecuación:


En la cual sabemos que ΔGº = -7,3 Kcal/mol.

En condiciones normales la ΔG es mayor de 7,3, es un valor más alto que variaría entre -11 y -16 Kcal/mol.

El valor de ΔGº’ se le llama potencia de transferencia de grupos fosfatos. Se llama no solo para el ATP, también para otros compuestos fosforilados.

Función del ATP en el metabolismo.

El ATP tiene un valor intermedio de energía y eso es importante para su función. El ATP no almacena la energía, de esto se ocupan otras moléculas como las grasas, el glucógeno o el almidón. Su función es más dinámica, hace de molécula intermediaria transportando energía desde los procesos que produzcan energía a los procesos que la consumen. Transfiere energía desde las moléculas energéticas y la lleva a moléculas menos energéticas.

Lo va a poder hacer por tener un ΔGº’ en un nivel intermedio en la escala de diferentes productos fosforilados. Va a poder dar energía para la fosforilación de compuestos con un ΔG más bajo en nivel absoluto (es decir, al ser más negativo, tendríamos que hablar de más alto si nos ceñimos a conceptos matemáticos). Por ejemplo, a la glucosa para formar glucosa 6 fosfato (G6P):

Glc + Pi G6P + H2O - ΔGº’ = +3,3 Kcal/mol
ATP + H2O ADP + Pi - ΔGº’ = -7,3 Kcal/mol
________________________________________
Glc + ATP ADP + G6P - ΔGº’ = -4 Kcal/mol

Se ha transferido un grupo fosfato del ATP a la glucosa.

El ADP se podrá fosforilar a ATP a partir de un compuesto fosforilado con más ΔGº’:

ADP + Pi ATP + H2O - ΔGº’ = +7,3 Kcal/mol
PEP + H2O Piruvato Pirúvico + Pi - ΔGº’ = -14,8 Kcal/mol
________________________________________
PEP + ADP ATP + Piruvato Pirúvico - ΔGº’ = -7,5 Kcal/mol

Si el ATP tuviera un ΔGº’ mayor no podría regenerarse con facilidad y si fuese más bajo no sería buen donante de energía. El ATP es la forma fundamental de intercambio energético. Pero hay otras.


Las fosforilaciones no solo se van a hacer por medio de procesos como el anterior. Hay más mecanismos más asociados, como las fosforilaciones a nivel de sustrato y las que tienen lugar en mitocondria y cloroplastos, que veremos a continuación.

Fosforilación a nivel de sustrato.

Está acoplada a la transformación enzimática de un sustrato. Vimos el ejemplo del fosfoenol pirúvico:


Fosforilaciones que tienen lugar en cloroplastos y mitocondrias.

La energía que se desprende en una cadena de transporte electrónico con la transferencia de un gradiente de protones. Es decir, un gradiente de protones genera una energía que hace que se produzca la siguiente reacción:

ADP + Pi ATP + H2O

En las mitocondrias esta cadena será la fosforilación oxidativa, que llevará a cabo la oxidación de una molécula orgánica.

En los cloroplastos el proceso global será el mismo, pero la fuente primaria de energía es la luz, no la oxidación de una molécula orgánica. Es la fotofosforilación.

En las células se emplean otros tipos de intermediarios, como el GTP, UTP y CTP. Y habrá enzimas que catalizan transformaciones como la siguiente:

GTP + ADP GDP + ATP

En esta reacción se transfieren los grupos fosfato.

Transferencias de poder reductor.

El poder reductor es otra forma intermediaria de energía. Va a haber dadores y aceptores de energía. Van a ser los coenzimas redox. Un compuesto redox puede tener una forma aceptora y una dadora de electrones (en eso consiste la transferencia redox). Las formas dadoras/aceptoras sería del tipo:

NADH/NAD+
FADH2/FAD
H2O/O2
Cu+/Cu2+
Fe2+/Fe3+

El cambio de electrones siempre se da entre la forma dadora de uno y la aceptora de otro (que será la forma oxidada). Las transferencias van de la dadora a la aceptora. Hay cuatro modalidades:
Que se transfieran electrones sueltos:

Fe2+ + Cu2+ Fe3+ + Cu+

En esta reacción un electrón pasa del Fe2+ al Cu2+

Que se transfieran en forma de hidrógeno:

SH2 + FAD S + FADH2
Que se transfiera un ión hidruro:

SH2 + NAD+ S + NADH + H+

En este caso un ión hidruro (H-) pasa del SH2 al NAD+.

Un compuesto reductor se combina covalentemente con oxígeno:

R-CH3 + ½ O2 R-CH2-OH

Se hagan las transferencias de una manera o de otra, el par redox tendrá un potencial eléctrico de oxidación característico que va a medir la mayor o menor tendencia que tendrá el compuesto a actuar como aceptor o dador. Se trata del potencial estándar, Eo’ y se medirá en voltios. Los más reductores serán los que tengan un potencial estándar más negativo.

Veamos el ejemplo del NADH con otros compuestos (los de más abajo tienen un potencial menos negativo o más positivo). Es decir, cuanto más negativo sea el potencial, más energético es el compuesto:


 Los electrones fluirán espontáneamente de los compuestos con potenciales más electronegativos a los más electropositivitos (de los Eo’ más pequeños, más negativos, a los mayores o más positivos):

NADH O2 – El NADH le pasa los electrones al O2. ΔG < 0. Este proceso ocurre durante la respiración.

H2O NADP+ - El H2O le pasa electrones al NADP+. ΔG > 0, por lo que se requiere energía. Esto ocurre en la fase luminosa de la fotosíntesis y la energía proviene de la luz.

Se cumple la siguiente ecuación:


Donde n es el número de electrones transferidos, F la constante d Faraday y *ΔEo’ el potencial redox.
Dado que es ΔGº’ las condiciones normales supuestas son 25ºC, pH 7 y concentraciones 1M.

En el caso de la reacción del NADH, la fórmula sería:


El principal transportador de electrones desde los procesos catabólicos (oxidativos) productores de electrones a los procesos biosintéticos reductores es el NADPH:


El NADH tiene otra función. Se utiliza para formar ATP mediante la cadena respiratoria de la fosforilación oxidativa.

sábado, 21 de abril de 2012

Anatomía básica del aparato reproductor


La reproducción es el proceso de formación de nuevos individuos de una especie, con el consiguiente traspaso de parte de la información genética.

El aparato reproductor posee un claro dimorfismo sexual, como es lógico en una especie dióica como la humana.
Venus de Botticelli
En el aparato reproductor, tanto masculino como femenino, podemos encontrar o diferenciar dos grandes partes. Por una parte, la encargada de fabricar células reproductoras, es decir, gametos y que se denominan gónadas. En los hombres las gónadas son los testículos y en las mujeres los ovarios. Además, se encargan de fabricar hormonas sexuales. Y por otra, habrá estructuras y células accesorias que colaboran en la el proceso reproductivo, de una u otra forma.

Aparato reproductor masculino.

Dentro del órgano reproductor podemos encontrar las gónadas, encargadas de fabricar las células reproductoras. Y las estructuras accesorias, compuestas por el sistema de conducción, las glándulas de secreción y el aparato de sostén.

Los testículos son dos glándulas ovaladas, de unos 5 centímetros de longitud y alrededor de 2,5 centímetros de diámetro. Se encuentran en una evaginación del abdomen, formada por un saco de piel denominado escroto. Están recubiertos de una membrana denominada túnica vaginal. Internamente, existe una cápsula fibrosa denominada túnica albugínea, que se proyecta al interior dividiendo el testículo en compartimentos denominados lóbulos.

Cada testículo posee entre 200 y 300 lóbulos y dentro de cada lóbulo, entre dos y tres túbulos seminíferos. Es en el interior de estos tubos donde se fabrican los espermatozoides. Los túbulos seminíferos confluyen en una estructura denominada red de Haller.

Los espermatozoides salen de los túbulos seminíferos a través de unos conductos denominados conductos eferentes. Los conductos eferentes confluyen en el epidídimo, una estructura con forma de parétesis situado en la parte posterior del testículo.

Del epidídimo sale el conducto deferente o conducto seminal. Conduce a los espermatozoides desde el epidídimo y atraviesa la próstata. Antes de llegar a la próstata, el conducto pasa a llamarse conducto eyaculador, tras fusionarse con el conducto procedente de la vesícula seminal. Los conductos eyaculadores desembocan en la uretra.

La uretra es un tubo de unos 20 centímetros y se divide en la uretra prostática, que mide unos 2 ó 3 centímetros, que atraviesa la próstata, la uretra membranosa, de alrededor de 1 centímetro de longitud y que atraviesa el diafragma urogenital y la uretra esponjosa, que mide unos 15 centímetros y atraviesa el pene. Desemboca al exterior por el orificio uretral externo.

Como hemos visto, a lo largo de todo el tubo vamos encontrándonos una serie de glándulas denominadas glándulas accesorias. La primera que encontramos es la vesícula seminal, con forma de saco de unos 5 centímetros y que se encarga de segregar un líquido rico en fructosa, que alimenta a los espermatozoides. Constituye alrededor del 60% del semen. Después encontramos la próstata, con forma de rosquilla y el tamaño aproximado de una castaña, encargada de segregar ácido cítrico y fosfatasa ácida. Y por último, las glándulas bulbouretrales o de Cowper, que segrega un líquido para neutralizar el medio ácido de la uretra.

El semen segregado tendrá un volumen de entre 2,5 y 5 mililitros, con entre 50 y 150 millones de espermatozoides en cada mililitro.

Para introducir los espermatozoides en la vagina, la estructura de sostén se denomina pene. Tiene forma de cilindro y se divide en raíz, la parte más cercana al abdomen, cuerpo, la zona central y glande, la parte delantera.

El cuerpo está constituido por tres estructuras con forma de saco. Dos de ellas forman los denominados cuerpos cavernosos.  El tercero, el cuerpo esponjoso, por el que discurre la uretra. Los tres sacos están surcados por vasos sanguíneos y en el momento en que el organismo considera que va a tener lugar algún tipo de contacto sexual, las arterias se dilatan, pasa mayor cantidad de sangre y a la vez se frena la salida venosa. De esta forma la sangre inunda los sacos, aumentando el volumen de la zona. Es el denominado proceso de erección.
Aparato reproductor masculino

Hormonas sexuales masculinas.

El hipotálamo segrega GnRH. Esta hormona promueve la liberación, en la hipófisis, de FSH y LH. La FSH estimula la espermatogénesis. La LH promueve que el testículo segregue testosterona. Cuando la espermatogénesis es alta, el testículo segrega otra hormona diferente, la inhibina, que actúa sobre la hipófisis de FSH y LH inhibiéndola, frenándola, así como frenando la secreción de GnRH del hipotálamo. Es decir, supone una retroalimentación negativa o retroinhibición. Si la concentración de testosterona se eleva en exceso también se inhibe la secreción de GnRH en el hipotálamo y de LH en la hipófisis.

La testosterona en si misma no es una hormona muy activa. Cuando llega a los tejidos donde debe actuar se transforma en Dihidrotestosterona (DHT) por la acción de un enzima, la 5α-Reductasa.
La DHT y la Testosterona participan en el desarrollo del patrón corporal masculino, desde la morfología de los genitales externos hasta ciertas modificaciones en el sistema nervioso central. Durante la pubertad, estimula el desarrollo muscular, el patrón de crecimiento del vello (desarrollo andrógino del vello púbico, aumento de la cantidad de vello axilar, facial y torácico, etc.). Sobre las glándulas sebáceas de la piel, estimula la secreción de grasa. Además, actúa como estimulador de la síntesis protéica. También sobre la conducta, comportamientos sexuales, etc.

Aparato reproductor femenino.

Las gónadas femeninas son los ovarios. Producen los gametos femeninos, que son los óvulos. Estos óvulos son generados en forma de ovocitos secundarios, que no se transformarán en óvulos maduros hasta después de la fecundación. Además, el ovario fabrica hormonas, fundamentalmente progesterona, estrógenos, relaxina e inhibina. Las estructuras accesorias son las trompas de Falopio, el útero, la vagina y los genitales externos, también denominados vulva. En algunos libros se consideran a los senos como órganos sexuales femeninos.Los ovarios son dos glándulas ovaladas, del tamaño aproximado de una almendra, situados en la cavidad pélvica, a ambos lados del útero. El ovario está recubierto por una túnica denominada túnica albugínea. Por debajo encontramos el epitelio germinal. Todo ello rodea al estroma. En el estroma se desarrollan los folículos ováricos y de ellos salen los oocitos (es decir, los óvulos).

Cuando del ovario sale un óvulo, este pasa a un conducto denominado trompa de Falopio. Se trata de un tubo de unos diez centímetros de longitud que conduce al óvulo hasta el útero. A la zona de la trompa que contacta con el ovario se denomina infundíbulo. Posee forma de embudo, con unas prolongaciones en forma de dedos denominadas fímbrias. En la trompa hay una zona ligeramente ensanchada denominada ampolla. La ampolla es el lugar donde, teóricamente, debería producirse la fecundación. El conducto se estrecha en la zona del conducto que contacta con el útero. A esa zona de contacto se le denomina istmo.
El útero o matriz es una estructura con forma de saco donde se producirá el desarrollo embrionario y crecerá el nuevo individuo. Antes del primer embarazo mide alrededor del 7,5cm de longitud y 5cm de anchura. Este saco puede dividirse en tres partes. La superior, de forma ensanchada, se denomina fondo. La parte central, que se va estrechando, se llama cuerpo. Y la inferior, estrecha y que comunica con la vagina, se denomina cuello. Al conducto que comunica al útero con la vagina se le llama conducto cervical o cérvix.

La pared del útero está constituido por tres capas diferentes. La más externa, que está en contacto con las vísceras, es una capa visceral, membranosa, denominada perimetrio. Por debajo se encuentra una capa muscular, responsable de las contracciones durante el parto y denominada miometrio. Y la capa más interna se denomina endometrio. El endometrio posee, a su vez, dos partes. La que se encuentra en contacto con el miometrio se denomina estrato basal. La que supone la pared interna del útero se denomina estrato funcional. El estrato funcional es el encargado de proteger al embrión en las primearas etapas del embarazo, tras la fecundación. Por eso debe estar en perfecto estado. Para lograrlo se recambia cada 28 días, estando en perfecto estado los días de máxima fertilidad.
Aparato reproductor femenino (frontal)
La vagina es el conducto que comunica el útero con el exterior. A través de ella sale el flujo menstrual, el bebé durante el parto y por el mismo deberán penetrar los espermatozoides. Generalmente por la vagina penetrará el pene del varón y dejará los espermatozoides en zonas cercanas al conducto cervical.
Se trata de un tubo membranoso muscular situado entre la vejiga urinaria y el recto. Se comunica con el exterior por el orificio vaginal. Este orificio puede estar recubierto por una membrana denominada himen.
En la zona de la salida de la vagina al exterior se encuentran los genitales externos femeninos o vulva. Entre sus componentes encontramos el monte de Venus, una elevación de tejido adiposo recubierto de piel y vello, cuya función es amortiguar la sínfisis púbica durante el acto sexual. Por otro están los labios mayores, dos pliegues externos cubiertos de vello y que se extienden de arriba abajo, desde el monte de Venus. Por debajo encontramos los labios menores, dos pliegues pequeños y carentes de vello que protegen la entrada de la vagina. El clítoris es una pequeña masa cilíndrica de tejido eréctil y nervios sensitivos situado en la unión de los labios menores. Y a la hendidura existente entre los labios menores se le denomina vestíbulo.
Aparato reproductor femenino (transversal)

El ciclo reproductor femenino.

Durante los años fértiles de la vida de la mujer, su aparato reproductor sufre una serie de cambios cíclicos que afectan fundamentalmente al útero y los ovarios, constituyendo el ciclo uterino o ciclo menstrual y el ciclo ovárico. Ambos constituyen el conocido como ciclo reproductor. Todo el ciclo se encuentra regulado por las hormonas sexuales.

Comencemos el ciclo después de la menstruación. Durante la menstruación se expulsa el óvulo fabricado durante el ciclo y se elimina el estrato funcional del endometrio. Tras ser eliminado el óvulo, comienzan a desarrollarse los nuevos folículos ováricos. Aunque comienzan a desarrollarse unos veinte, normalmente solo uno completará su desarrollo. El desarrollo se acelera, sobre todo, a partir del sexto día. Los folículos, en respuesta a la llegada de FSH y LH se desarrollan y fabrican estrógenos, fundamentalmente estrol y β-estradiol. Los estrógenos, a baja concentración, provocan inhibición de la FSH y LH. Al bajar la FSH provoca que solo se desarrolle uno de los folículos y los demás cesen en su desarrollo. Este folículo madurará, transformándose en un folículo de Graaf. Poco a poco, se va elevando la cantidad de LH segregada, lo que hace que sea aproxime la ovulación. El folículo de Graaf sigue fabricando estrógenos, que promueven el desarrollo del endometrio. Los niveles altos de estrógenos estimulan la secreción de GnRH por el hipotálamo y además estimula la secreción de LH. Por lo tanto, aumenta tanto la LH como la FSH, pero la LH en mayor nivel. El folículo de Graaf se desarrolla hasta un punto en el que los niveles de LH son tan altos que se desencadena la ovulación. El óvulo abandona al folículo y pasa a la trompa de Falopio. En ese momento los estrógenos sufren una caída, ya que el folículo deja de fabricarlos. El folículo vacío comienza a degenerar y se transformará en el cuerpo amarillo, gracias a la acción de la LH. El cuerpo amarillo segrega estrógenos y progesterona. En estos mementos estamos en el día 14 del ciclo. La progesterona estimula a que la pared del útero crezca y se prepare para albergar al embrión en caso de fecundación.

Ahora tenemos dos opciones, que haya fecundación o que no haya fecundación. Si no hay fecundación, se produce una elevación pareja de estrógenos y progesterona, segregadas por el cuerpo amarillo. Ambas hormonas, actuando de forma pareja, inhiben la secreción de LH y GnRH. El cuerpo amarillo se transforma en cuerpo blanco y el cuerpo blanco deja de segregar progesterona y estrógenos. Al caer la progesterona y los estrógenos, cesa la inhibición sobre el hipotálamo y la hipófisis y vuelven a elevarse tanto la LH como la FSH. Esta elevación provoca que se desencadene la menstruación, dando final al ciclo y comenzando el nuevo ciclo menstrual.

Si hubiese fecundación, el óvulo fecundado se implantará. Al óvulo fecundado implantado se denomina córion. El corion comienza a fabricar gonadotropina coriónica humana (hCG). Esta hormona evita que el cuerpo amarillo se transforme en cuerpo blanco. Esto hace que los niveles de progesterona y estrógenos se mantenga, no disminuya y por eso no se desencadena la menstruación. El óvulo implantado comienza a fabricar la placenta. Y la placenta fabrica las hormonas, estrógenos y progesterona. En la medida en que la hormona comienza a fabricarlas, el cuerpo amarillo deja de fabricarlas.
Ciclo ovárico
Fecundación.

Durante la fecundación, el material genético del óvulo y del espermatozoide se fusionan. Debemos recordar que ambas células tienen la mitad de dotación genética (n) gracias a las meiosis que sufren durante su formación. Al unirse, constituirán la célula diploide (2n) que, en sucesivas divisiones, acabará dando lugar al nuevo individuo.

Como media, el hombre deposita en la vagina de la mujer entre 300 y 500 millones de espermatozoides. De todos ellos, solo el 1% llegará a las zonas próximas al óvulo y solo uno completará, de forma efectiva, la fecundación.

Tras la unión, comienzan una serie de divisiones mitóticas rápidas y consecutivas, denominadas segmentación. Durante los primeros días, se dividirá sin crecer de tamaño, aumentando solo el número de células (que son cada vez más pequeñas, lógicamente). A las 96 horas, se ha formado una estructura denominada mórula. A los 5 días, se denominará blastocito. El blastocito penetra en el útero y se une a la pared uterina en un proceso denominado implantación.

A partir de este momento, comienza el desarrollo embrionario propiamente dicho. El proceso durará nueve meses. La placenta se formará a los tres meses, constituyéndose en parte por el embrión y en parte por el endometrio uterino. La placenta se encargará de la nutrición y respiración del embrión en crecimiento, que cada vez necesitará mayor aporte de nutrientes y oxígeno. Al avanzar el desarrollo, comenzaremos a hablar de feto.

El feto se desprenderá de la placenta tras el nacimiento o alumbramiento. Hasta el último momento, el feto se encuentra enganchado a la placenta por medio del cordón umbilical, que pone en contacto el plasma sanguíneo de la madre y del feto.

domingo, 15 de abril de 2012

Membranas biológicas

Una de las mayores diferencias ente las células eucariotas y procariotas es que las primeras tienen un complejo sistemas de membranas internas. Se encargan de separar compartimentos estancos entre si.
Hay muchos tipos de membranas celulares. Son algo más que sistemas de la célula:
  • Forman o aíslan compartimentos cerrados.
  • Regulan el paso o movimientos de sustancias a través de ellas.
  • Se encargan del paso de información: las membranas tienen receptores específicos de un ligando.
  • Se encargan del reconocimiento intercelular.
  • Son la plataforma donde se van a ordenar los componentes de un determinado proceso.
  • Se encargan de transducciones de energía y transformaciones de energía.
  • Participan en la transmisión del impulso nervioso.
  • Se encargan de la absorción de sustancias.
  • Etcétera.

La membrana es una estructura estudiada a finales del siglo XIX. Se basaron en observaciones en las que se veía que los compuestos liposolubles atravesaban mejor la membrana que las sustancias hidrosolubles.
Con la microscopía electrónica se consiguió una visualización de la membrana, aunque algo artefactual. Los primeros modelos eran algo erróneos. Lysec estudió la membrana usando un glóbulo rojo. Esta célula solo presenta membrana plasmática, careciendo de núcleo y orgánulos. Por eso se sigue usando mucho para el estudio de membranas. Se observó que, si se disolvía la membrana y se ponía en medio acuoso, aparecía una capa de naturaleza grasa. Prácticamente, la membrana disuelta ocupaba el doble, aproximadamente, de la superficie total del eritrocito. La membrana debía ser, por lo tanto, doble. Se trata, por lo tanto, de una bicapa.

Con microscopía electrónica se observa una estructura similar a la siguiente:
El material fibrilar puede aparecer o no aparecer, de hecho no se aprecia en muchas células. En células con actividad de trasiego de sustancias, en cambio, tiende a ser una capa más densa.

Se postuló que la membrana no era solamente una bicapa lipídico. Se vio rápidamente que aparecían proteínas asociadas. Estas darían cohesión a la membrana y facilitarían el paso de compuestos hidrófilos.
Danielli propuso una membrana que estaría constituida por una bicapa lipídica envuelta o tapizada por una envuelta protéica, de forma que las proteínas constituirían las zonas electrondensas.
Membrana de Danielli
Con el paso del tiempo y la aparición de nuevos métodos se pudo comprobar que la teoría tenía errores. Había sustancias que eran transportadas por la membrana muy fácilmente. Por lo tanto, en esta estructura de membrana con tapizado deberían existir una serie de huecos. Y estos huecos estarían tapizados por las proteínas. La aparición de estos huecos, además, se veían confirmadas por algunas imágenes micrográficas que parecían responder a este modelo.
Hubo diversas modificaciones a este modelo de membrana. Se estableció el contexto de unidad de membrana aplicado a esa imagen en forma de emparedado que se veía en el microscopio electrónico. Se llegó a un diseño de modelo de membrana que poseía dos aspectos nuevos. Por un lado, la distribución de las proteínas, que se unían de una forma más íntima a los lípidos. En el nuevo modelo de membrana están asociados íntimamente a los lípidos. Y por otro lado están las condiciones de fluidez de la membrana. El nuevo modelo de membrana, denominado modelo del mosaico fluido, es el que hoy en día se contempla y admite.
Fue propuesta por Singer y Nicolson en 1972. Las membranas son soluciones bidimensionales de lípidos y proteínas orientados:
Modelo del mosaico fluido
La bicapa lipídica crea una barrera en la que se asientan las proteínas. Las dos capas densas están formadas por las partes hidrófilas. La capa intermedia está formada por la parte hidrófoba.

Las proteínas periféricas son hidrófilas. Se unen a la membrana por interacciones hidrofílicas con las cabezas de los lípidos o a las partes hidrófilas de las proteínas integrales.

Las proteínas integrales están unidas a la bicapa lipídica. Son en gran parte hidrófobas. Están sujetas por interacción hidrófoba.

Dentro de las proteínas integrales las hay transmembrana, si la atraviesan de parte a parte. Es frecuente que se formen en las integrales, poros hidrófobos.

No hay enlaces covalentes. Se basa en la cooperación de muchos enlaces débiles.

Los hidratos de carbono siempre están hacia el exterior, nunca hacia el citoplasma.

Se mantiene la existencia de una bicapa lipídica y de un contenido protéico. En el caso de las proteínas, se cambia bastante su posición. Muchas proteínas están sumergidas, total o parcialmente, en la bicapa. Se sabe que existen proteínas que se encuentran por la parte exterior de la bicapa, enlazadas con los lípidos de la membrana o con otras proteínas. Además, en la cara exterior o  extracitoplasmática, la que mira al exterior de la célula, existe un componente glucídico. Este modelo explica mejor las características físico – químicas de la membrana.

Hay una gran movilidad en la bicapa, no solo de las proteínas, también de los lípidos. No son estáticos.
Falta otro detalle. Las fibrillas que se ven en microscopía electrónica. Se trata del componente glicídico, los polisacáridos unidos sobre todo a ciertas proteínas, formando un entramado. Algunos lípidos presentan también componentes glucídicos.

Las membranas, por lo tanto, son asimétricas. Y una de estas asimetrías es la disposición de los árboles de azúcares, que como acabamos de decir están solo en una de las caras de la membrana. En el caso de la membrana plasmática, ya indicamos que están hacia el exterior. Cuando están muy desarrollados, los árboles son muy grandes, hablamos de glucocálix. En las membranas internas, como el aparato de Golgi, o en vesículas interiores, los azúcares se sitúan hacia la cara interior o luminar de las mismas.

En las células, en el interior de cloroplastos o mitocondrias, no hay hidratos de carbono. En las bacterias, a veces, los lípidos de una monocapa no corresponden con el de la otra monocapa.

Los fosfolípidos tampoco son simétricos. En la membrana de los eritrocitos, en la cara exterior, encontramos fundamentalmente fosfatidilcolina. En la interior hay otros fosfolípidos.

Las proteínas transmembrana tienen una orientación fija, siempre es la misma. En el eritrocito, la glicoforina siempre se coloca de la misma manera.

Las proteínas de membrana se sintetizan en los ribosomas que están pegados a la membrana. La conformación tiene que ver con el transporte a través de la membrana.

Un nuevo dato microscópico vino a solucionar problemas y a confirmar el nuevo modelo. Cuando preparamos imágenes por criofractura, las muestras se parecen más a la realidad, ya que no se llevan a cabo inclusiones ni fijaciones. Con este tipo de microscopía se ve una membrana distinta. Hay dos capas similares, que corresponden a las dos hemicapas lipídicas, con una zona intermedia más frágil. En muchas ocasiones la célula, en lugar de partirse por la mitad, se separan las dos hemimembranas. Se compraba que son muy parecidas, que presentan una alternancia de zonas lisas y zonas con huecos o estructuras que sobresalen. Además, estos son complementarios. La explicación que se da está en relación con el mosaico fluido, las dos hemimembranas corresponden a dos partes de la membrana lipídica. La zona que separa las dos hemimembranas son las zonas con menos enlaces, son poco resistentes, lo que facilita que en la criofractura sea por esa zona por donde se rompa, por donde se separe. Por otro lado, cuando se separa, cada lado tira de sus proteínas. Las proteínas exteriores no tienen problema, pero las que están dentro de la bicapa se van hacia uno de los dos lados, quedando un hueco en el lado del que son arrancadas y un saliente en la zona donde se queda enganchada la proteína.
Imágenes de criofractura
Además, existen una serie de datos que corroboran todo esto. Hay una diferencia notable, no obstante, entre diferentes tipos de membranas. La composición lipidica es variable y las proteínas son distintas, aunque algunas puedan estar presentes en todas las membranas. Hay membranas muy ricas en proteínas, mientras que otras poseen muchas menos. Cuando una célula posee una actividad biológica importante, habrá muchas proteínas. Por ejemplo en los tilacoides, donde tiene lugar la fotosíntesis, aparece un número elevado de proteínas. Sin embargo, cuando se hace un estudio de la membrana que forma parte de la vaina de mielina (que se encarga de aumentar la velocidad del impulso nervioso en las fibras más evolucionadas), que actúa como aislante (equivalente al aislante que envuelve los cables eléctricos) esta es casi una bicapa lipídica casi exclusivamente, apareciendo muy pocas proteínas, ya que la membrana está especializada en aislar.
Vaina de mielina de los axones
Y si realizamos criofracturas comprobamos que aparece una gran zona lisa, sin entrantes ni salientes, con alguna proteína perdida en el medio.

Se ha llegado a la conclusión de que, debido a la fijación, exclusión y resto de técnicas agresivas previas a la microscopía electrónica, se produce una desorganización de la membrana plasmática, con pérdida del componente protéico intermembrana. De ahí la imagen errónea del microscopio electrónico de transmisión (sin técnica de criofractura).

La membrana tiene, por lo tanto, un componente lipídico, un componente protéico y un componente glucídico.

Todas las membranas estudiadas tienen una estructura semejante, con una composición de alrededor de un 40% de lípidos y un 60% de proteínas, pudiendo llegar a estar incluso invertidos estos datos, es decir, 60% de lípidos y 40% de proteínas.

Fosfolípidos.

Fosfolípido
La independencia de las células se deben al comportamiento de los lípidos en medio acuoso. Tienen una dualidad en cuanto a su comportamiento frente al agua. la molécula presenta dos zonas, una zona hidrofílica y una zona lipofílicas. Es decir, se trata de moléculas anfipáticas.

Los lípidos de la membrana biológico están en un grupo muy característico, pertenece a los fosfolípidos. En el caso de eucariotas, está también el colesterol.
Esquema del colesterol
Los lípidos tienden a esconder la cola hidrfóbica, formar micelas o formar bicapas protectoras.
Para los fosfolípidos y glucolípidos, la estructura más estable es la bicapa. Se adaptan espontáneamente. Las bicapas forman vesículas. Se les llama liposomas. Las fuerzas que las estabilizan son las interacciones hidrófobas entre las colas y las interacciones de Van der Wallas al estar muy cerca. Por otro lado, las cabezas polares pueden formar puentes de hidrógeno o puentes salinos con el medio acuoso.
Fosfolípido




Muchas membranas tienen muchos tipos de fosfolípidos. Por ejemplo, en algunas aparecen los esfingolípidos, que son lípidos que derivan de la esfingosina. En los esfingolípidos el grupo polar estará constituido por algún hidrato de carbono. Es decir, las dos moléculas hidrófobas provienen, una de la esfingosina y otra del ácido graso.
Esfingosina



Esta estructura en lámina debe ponerse en un medio que aísle el agua. por ejemplo, en forma de anillo. Lo que ocurre es que se cierra la bicapa en una forma esférica. Esta forma de cerrarse es lo que se supone que sucedió en las primeras células. Se creó una estructura en la que hay un medio interno. Y sin gasto de energía, se consigue tener una superficie que, espontáneamente, aísla el interior del exterior.

Además, la membrana es un medio muy aislante, solo es atravesada por sustancias liposolubles. Por otro lado, se puede variar el aislamiento, por medio de compuestos o estructuras que la atraviesen. Se puede perforar  se cerrará automáticamente, de forma espontánea, sin gasto de energía. El paso de sustancias se lleva a cabo gracias a proteínas. El sistema de ruptura y reposición de la membrana es aprovechado por el proceso de exocitosis y endocitosis, que sirve para introducir o sacar grandes cantidades de sustancias.

Los lípidos son de composición variable. Los lípidos de la membrana son además moléculas con una movilidad elevada. Se han demostrado estos movimientos de los fosfolípidos mediante resonancia de espín electrónico. Se marcan determinados lípidos con grupos químicos con un electrón desapareado. Y así vemos que los lípidos tienen movimientos de difusión lateral, de rotación sobre su eje y movimientos de inversión en la membrana o movimiento flip-flop. Este último movimiento es casi inexistente, con excepción de ciertas zonas de membrana como la membrana del retículo endoplásmico, debido al mecanismo de fabricación de la membrana. Los movimientos laterales, en cambio, se realizan sin problemas. Cada célula modifica su membrana para que los movimientos no se hagan de forma azarosa, sino ordenadamente.
Movimientos de los fosfolpidos
El papel de los lípidos es importante. Además de para separar la célula del exterior, aportan la fluidez a la membrana. La fluidez vine dada en función de lo cerca o lejos que esté la membrana de su punto de congelación con respecto a la temperatura normal de la célula. Cuanto más cerca esté el punto de congelación de la membrana, más rígida será.

Este punto de congelación, a su vez, viene mediado por la molécula de lípido de los fosfolípidos y es decir, fundamentalmente por la cola hidrofóbica. Esa cola forma enlaces. Cuantos más enlaces se formen, más cerca estará del punto de congelación y más rígida será la membrana. La mayor o menor facilidad para crear enlaces viene determinada por el tamaño de la cadena y su grado de saturación. Si hay instauraciones, es decir, dobles enlaces, se produce un quebramiento de la cola. Cuanto más largas y rectas sean las colas, más enlaces van a poder formarse entre si. En cambio, si hay dobles enlaces, al aparecer quebramientos en el lípido, hay un alejamiento entre ellos, que provoca que se aleje del punto de congelación.

Otra propiedad importante de las membranas será su fluidez. Por una parte está la fluidez de los propios lípidos. Tienen varios tipos de movimientos dentro de la bicapa.

Los lípidos se pueden desplazar rápidamente dentro de una misma monocapa y conservando su orientación.

Hay factores que influyen en la fluidez de la membrana. A más temperatura, más fluidez y viceversa. Se habla de temperatura de transición, que sería la temperatura en la que la membrana pasa de tener una consistencia líquida a pasa a una consistencia de gel cristalino. Cada membrana tendrá su propia temperatura de transición.

Otros factores serán los factores de composición. Son fundamentalmente tres:
  • Grado de saturación de los ácidos grasos. Cuando hay un mayor número de ácidos grasos con dobles enlaces, la cadena hace quiebros, las colas tienen dobleces en lugar de ir rectas, provocándose huecos. Esto hace que la membrana sea más fluida y su temperatura de transición más baja.
  • Ácidos grasos de cadena corta. Se dificulta el empaquetamiento por lo que la membrana se hace más fluida. Al igual que en el caso anterior, se crean huecos que provocan que las fuerzas de Van der Waals sean menos efectivas.
  • Presencia de colesterol: solo aparece en eucariotas, nunca en procariotas. Modula la fluidez. A temperatura alta, el colesterol evita el exceso de fluidez. Y viceversa, cuando la temperatura es baja, evita la cristalización. Hace un efecto de unión, acerca las moléculas. Por otro lado, separa las moléculas disminuyendo la fluidez. Es decir, depende de como se coloque. Hace que los cambios de temperatura no se hagan sentir en exceso.

 Si las membranas están compuestas por un tipo de lípidos, cuando baja la temperatura, llegaremos a conseguir una rigidez en la bicapa. Si hay varios tipos de lípidos, se formarán islas, es decir, los más fluidos se van uniendo entre si. En las membranas biológicas esto no ocurre, porque suelen poseer una cola saturada y una cola insaturada, lo que hace que las características se repartan y no aparezcan islotes. Debemos tener en cuenta que estos islotes provocarían la ruptura de la membrana. De esta forma, las células animales pueden aguantar temperaturas de entre -20ºC hasta +50ºC.

La célula puede solventar los problemas de fluidez de muchas maneras. Los organismos inferiores cambian la composición de las colas de la membrana. En eucariotas no hay un control de este tipo. Pero encontramos el colesterol, que mencionamos con anterioridad. Es una molécula de pequeño tamaño, más pequeña que los fosfolípidos. Se suele colocar entre las colas de los fosfolípidos. Tiene un grupo polar pequeño.
Colesterol en la membrana
Colesterol en bicapa
Puede desplazarse por la membrana, saltando de una hemimembrana a la otra. Hacen de cuña, separan los ácidos grasos impidiendo que se formen enlaces entre ellos. Intervienen facilitando los problemas de expansión de las membranas. Favorecen que los movimientos se hagan sin que la membrana se rompa. Esto se demuestra trabajando con cepas celulares mutantes que engan la desventaja de no poder fabricar coleserol. Si este no es aportado en la dieta celular, en las membranas aparecerán agujeros y la célula se lisará.

Los lípidos da una asimetría típica a las membranas. Las hemimembranas externa e interna son distintas. Esta asimetría viene dada ya desde su construcción. Uno de los motivos es que los lípidos forman un papel importante en su unión con las proteínas. Algunas proteínas necesitan unos grupos químicos para funcionar, que son aportados por los lípidos. Hay proteínas que requieren lípidos. En cada hemimembrana, las proteínas se sitúan de forma preferencial en una zona, en un lado y en una posición concreta.

Otro ejemplo de asimetría se da, por ejemplo, en la membrana de los eritrocitos. En la cara exterior, encontramos fundamentalmente fosfatidilcolina. En la interior hay otros fosfolípidos.

Hay un tipo de lípidos, los glucolípidos, que llevan un árbol de azúcares en la cabeza polar. Normalmente llevan un único árbol de azúcares, cuya composición es variable. El sentido de estos no está muy claro. Se cree que actúan como contactos de reconocimiento. Hay una serie de identificadores celulares, se sabe que actúan como receptores. Por ejemplo, en el cólera, la bacteria se une solo a unos glucolípidos de las células intestinales.

Proteínas de membrana.

Son un componente que le permite que las membranas adquieran propiedades evolutivas y adaptativas: permiten el transporte, hace que la membrana sea un buen sitio para que se lleven a cabo reacciones químicas, etc.

Se han estudiado mediante métodos de fraccionamiento celular. Se ha visto que hay unas proteínas menos relacionadas con la membrana, que se sueltan con facilidad y otras más relacionadas, que no se sueltan fácilmente. Se clasifican en extrínsecas e integrales. Las integrales se unen muy bien a la membrana. Las extrínsecas no suelen unirse con fuerza, están ligeramente apoyadas sobre la bicapa lipídica. Para extraer las proteínas integrales debemos destrozar la membrana.
Proteína de membrana
Las técnicas de purificación son cada vez más sofisticadas y evolucionadas y cada vez se conocen más y mejor las proteínas de membrana. Se suele usar, para su estudio, la membrana del eritrocito.
Dentro de la membrana podemos encontrar varios tipos de proteínas.

Por un lado están las proteínas transmembranales. Dentro de estas podemos diferenciar dos tipos, las que atraviesan la membrana una vez y las que la atraviesan varias veces. El sector que atraviesa la membrana suele encontrarse en forma de hélice α (aunque en ocasiones también podemos encontrar zonas del interior de la membrana en forma de lámina).
Proteínas integrales.
Por otro lado encontramos proteínas unidas a fosfolípidos, es decir, proteínas que se encuentran unidas a los fosfolípidos de la membrana.
Proteínas unidas a fosfolípidos
Una tercera opción es la aparición de proteínas unidas a glucolípidos.
Proteína unida a glúcido de un glucolípido
La cuarta y última opción son las proteínas unidas a otras proteínas de membrana.
Proteínas unidas a proteínas.
Las proteínas pueden unirse, por lo tanto, entre si formando complejos.
Complejo protéico
También pueden unirse a otras estructuras, como a fibras del citoesqueleto:
Proteínas de membrana unidas al citoesqueleto
Las proteínas de membrana tienen una amplia movilidad. Poseen difusión lateral alta, rotacional (con menor velocidad) y prácticamente no hacen movimientos flip-flop. Hay procesos en ciertas membranas que se llevan a cabo mediante un movimiento flip-flop de la proteína.
Proteínas de membrana
La difusión se ha demostrado mediante varias estrategias. No pudo probarse hasta que no se consiguieron híbridos moleculares de las proteínas celulares (mediante el uso de virus) y mecanismos de fusión celular. Se consiguen una célula de ratón con un determinante antigénico concreto, normalmente que será marcado con un anticuerpo que presenta fluorocromo, haciendo la proteína visible al microscopio óptico. Se consigue otra célula de ratón similar a la anterior, pero con un marcador antigénico diferente, que será marcado por lo tanto con un anticuerpo diferente y que poseerá un fluorocromo de otro color. Inducimos la fusión de las dos células y observamos como evolucionan las proteínas, cómo se van moviendo a través de la célula formada de la fusión de las dos células iniciales. Inicialmente, se colocarán en dos hemisferios derivados de la fusión, uno de los hemisferios rico en una de las proteínas y el otro rico en el otro tipo de proteína.
Movimientos de proteínas
Progresivamente, se van entremezclando. Se acaba con una coloración intermedia, derivada de la mezcla uniforme de los dos fluorocromos. Las proteínas de membrana, por lo tanto, se han movido por la membrana celular.

Este tipo de experimentos se repitieron con otras metodologías, consistentes en marcar con fluorocromos los determinantes antigénicos. Posteriormente se decoloran los determinantes de una zona de la célula, anulando la fluorescencia (usando normalmente una luz láser débil, que al incidir sobre la zona agota la capacidad del fluorocromo de emitir luz). La mancha sin color se mantiene un tiempo variable, pero acaba desapareciendo, pues las proteínas de membrana van ocupando esa zona. Se puede medir el tiempo que tardan las proteínas en ocupar la zona y hacer tablas, midiendo de este modo la velocidad de la membrana. Mediante esta técnica se ha podido establecer que la membrana más rápida es la de los fotorreceptores.
A la célula le interesa que exista una movilidad, pero esta debe ser controlada. En las células se establecen dominios de membrana, zonas de frontera en cuyos sitios se pueden mover las proteínas, pero de los cuales estas no pueden salir.

Hay dos factores que modulan la rapidez con la que se mueven. Por un lado, la fluidez de la bicapa. Por otro, el tamaño o peso molecular de la proteína. Si tiene un peso molecular elevado, se mueve más despacio.

En el caso de un organismo pluricelular, como ocurre por ejemplo con las células epiteliales del intestino delgado, aparecerán células con una polaridad elevada. En el caso concreto de las células epiteliales del intestino delgado, estas presentan una zona con microvellosidades que mira a la luz del tubo y una zona inferior que se encuentra en contacto con el tejido conjuntivo y los vasos sanguíneos. Cada polo requiere un componente protéico específico, las proteínas no se pueden mezclar (funcionaría mal y habría un gasto excesivo de proteínas).
Dominios de membrana
Hay un sistema de establecimiento de dominios de membrana. Existen modificaciones, especializaciones en la membrana. En concreto, en el epitelio, encontramos lo que se denomina zónula ocludens, que separa los territorios apical del basal. Se trata de zonas de sellado, en forma de cinturón que rodea totalmente la célula. Este sellado ayudará a establecer dominios en la membrana. Ni siquiera los fosfolípidos pueden pasar por esa zona, es decir, hace que ni los componentes de la membrana puedan pasar libremente. Pero esto solo ocurre para la hemimembrana externa, mientras la interna permanecería con libertad de paso.
Dominio en Zónula Ocludens
También pueden formarse barreras submembrana, mediante proteínas de anclaje.
Proteínas de anclaje en dominios de membrana
Un ejemplo de este tipo de proteínas es el que aparece en el espermatozoide. Hay tres dominios de membrana, en la cabeza, cuello y cola. Se cree que estos dominios son establecidos mediante proteínas submembranosas de anclaje. Aunque se trata sólo de una teoría y no está muy claro el verdadero sistema por el que se establecen dominios es estas células.

En cuanto a las glicoproteínas o glucoproteínas, estas se encuentran ubicadas en las membranas, en la zona que mira hacia el espacio extracelular o en las membranas interiores, mirando hacia al hueco de la vesícula o del orgánulo en cuestión. Es decir, siempre miran al lado contrario al citoplasma.

Los árboles de azúcares parecen relacionados con fenómenos de reconocimiento celular y mecanismos de filtrado. Constituyen lo que se denomina glicocálix. Y resulta muy variable, apreciándose grueso en algunas células y más fino en otras.

No obstante, los árboles de azúcares son de mayor tamaño cuando se encuentran anclados a los lípidos (glucolípidos) que cuando se encuentran anclados a proteínas (glicoproteínas).

domingo, 8 de abril de 2012

Enzimas: energía de activación


Los enzimas son los catalizadores de las células. Sin ellos, la vida sería imposible, pues no se podría vivir a la temperatura y presión que en teoría serían necesarias para que las reacciones se produjeran.
Los enzimas no se consumen. Tienen dos propiedades:
  • Poder catalítico: dispara las reacciones químicas, hasta incluso un millón de veces más deprisa.
  • Especificidad: respecto del sustrato o ligando y en cuanto a la transformación que cataliza.


Dentro de una célula habrá cientos de enzimas distintos. La especificidad hace que dentro de un mismo compartimento puedan tener lugar, a la vez, cientos de reacciones distintas sin que se confundan.

Por otro lado, algunos enzimas tienen también capacidad reguladora.

En cuanto a su nomenclatura, tiene que incluir el nombre del sustrato y el tipo de transformación. Suele acabar en el sufijo -asa, indicando en la primera parte del nombre el sustrato seguido de la función. Por ejemplo, isocitrato deshidrogenasa.

Si en su nombre solo aparece el sustrato seguido del sufijo -asa es que su función es la hidrólisis. Por ejemplo, las proteasas hidrolizan proteínas.

Energía de activación.

Sería la cantidad de energía que habría que aplicar a un sustrato para que comience la reacción.
Hay muchas reacciones con un ΔG < 0 y que no tienen lugar o tienen lugar a velocidades muy bajas. Se debe a la falta de energía de activación. Estos sustratos deben pasar la barrera energética para poder transformarse en productos.

La energía de activación ΔG++ es la energía necesaria para llevar al sustrato hasta el estado de transición a una temperatura determinada.

En una solución no todas pueden llegar al estado de transición, ya que por los propios movimientos al azar de las moléculas, no todas estarán a la misma energía. Solo las que tengan un nivel energético más alto podrán transformarse. La velocidad de reacción es proporcional a las moléculas en estado de transición.
Un método para aumentar la velocidad de reacción es aumentar la temperatura o la presión. Pero estos métodos no serían viables en las células.
Los enzimas aumentan la velocidad de reacción. En vez de aumentar la energía de las moléculas, lo que hacemos es rebajar la energía de activación. El enzima reacciona con el sustrato, formando un complejo enzima - sustrato que tiene un estado de transición de energía más baja. Tiene una mayor probabilidad de formarse. Por lo tanto, se aumenta la velocidad de reacción:

S + E SE SE++ P + E

Donde S es el sustrato, E el enzima, SE el complejo enzima - sustrato y P el producto.

El ΔG depende del punto de partida y de llegada, no de los pasos intermedios. Por eso, ΔG es constante para una reacción determinada.

Los enzimas no varían la constante de equilibrio K, ya que aceleran la reacción en ambos sentidos. Multiplican por un número los dos factores de la ecuación. Lo que ocurre es que se llega al equilibrio a mayor velocidad:
De forma que: 

Para que la reacción tenga lugar, debe superarse la energía de transición de mayor energía.

Para la mayoría de los enzimas, la velocidad de reacción se va a modificar en función de la concentración según esta curva (para una concentración de enzima constante):
Llega un punto en que se alcanza la velocidad máxima, en la cual, por más que aumentemos la concentración de sustrato inicial, la velocidad no aumenta. Habría que aumentar la concentración de enzima para que la velocidad aumentase.

Esto se explica por la teoría de Michaelis, que dice que el enzima se combina con el sustrato, dando lugar a un intermediario sustrato - enzima produciéndose de ese modo la reacción. Hay una cantidad de intermediario sustrato - enzima máximo. En cuanto todo el enzima que teníamos se satura, ya no puede capturar más y no puede aumentar más la velocidad. Es el momento en el que la velocidad es máxima y estamos en el estado de saturación del enzima. La ecuación de Michaelis - Menten sería:
Se llega a la saturación cuando la concentración total de enzima es igual a la concentración de enzima y sustrato unidos: [ET] = [ES].

La primera parte de la reacción es más rápida. la segunda parte es más lenta y por lo tanto la que va a determinar la velocidad de reacción.
Consideramos que al principio de la reacción es mucho K3 menor que K4 y por lo tanto podemos desperdiciar K4. La segunda reacción quedaría establecida en un solo sentido: ES E + P, siendo su constante K3. Por lo tanto la ecuación que nos da la velocidad de reacción sería:
A K3 se le denomina número de recambio o constante catalítica. Corresponde al número máximo de moléculas de sustrato transformadas en producto por un enzima por unidad de tiempo. Por eso se habla de Kcat.

Cuando el enzima trabaja a pleno rendimiento, [ES] = [ET]. En esas circunstancias, V0 = Vmax y por lo tanto tendremos la ecuación:
Si la relación entre [ES] y [ET] fuese distinta al 100%, no obtendríamos la velocidad máxima, sino ese mismo porcentaje de la velocidad máxima. Por ejemplo, si l relación fuese el 30% la velocidad obtenida sería el 30% de la velocidad máxima.

Michaelis-Menten llegaron a la siguiente fórmula:
Donde KM es la concentración de S para que V sea la mitad de la máxima, es decir:
Y de esta forma, ya que la V es la mitad de la máxima:
Por lo tanto:
Y al final obtendríamos que:
Km = [S]max/s Expresado en mol/l

Cada enzima posee una KM constante. Y como cada enzima es específico par aun sustrato, tenemos la constante para la reacción concreta.

La KM es constante para la concentración de enzima total:

La constante de disociación del enzima al sustrato KES, (K2 / K1), es igual que KM:
Pero como K2 >> K3 podremos despreciar K3 y por lo tanto:
Se trata de una medida de la afinidad del enzima por el sustrato. Valores altos de estas constantes de equilibrio equivalen a decir que el sustrato y el enzima no son muy afines. Valores muy bajos, en cambio, equivalen a decir que el complejo se disocia con dificultad, es decir, que son muy afines.

Podremos también deducir la ecuación de Linewaner-Burk:
Podremos realizar la siguiente representación gráfica, que es más exacta que la de Michaelis-Menden a la hora de calcular KM y Vmax.
Si un enzima trabaja sobre tres productos a la vez, podrían existir varias y se complicaría un poco el caso.

El pH afecta al enzima y al sustrato. La mayoría de los enzimas solo serán eficaces a un cierto valor de pH:
Otro factor que influye en la velocidad de reacción es la temperatura, que aumenta la velocidad de reacción en ausencia de enzima. Aproximadamente, sin enzima, cada 10ºC se duplica la velocidad de reacción. Pero cuando hay enzimas, a temperaturas elevadas, generalmente por encima de 40ºC, el calor comenzará a desnaturalizar al enzima. Es una situación que nunca se dará dentro de la célula.
Todo esto explica cómo actúa el enzima fuera de la célula. Dentro de la célula hay varias incógnitas. En las células el funcionamiento del enzima está influenciado por cómo están organizados los sistemas multienzimáticos, ya que en es el conjunto de todos ellos los que catalizan una ruta metabólica.

Esto sería un ejemplo de ruta metabólica con enzimas:
Antes de actuar como sustrato de otra reacción, debe encontrarse con su enzima correspondiente. Se ha perdido un tiempo de difusión. La velocidad total de la ruta se va a ver limitada por esa velocidad de difusión entre un enzima y otro. A mayor concentración de los sustratos o de los enzimas, aumentará la velocidad de reacción. Lo que pasa es que la célula tiene una capacidad limitada. Para aumentar la velocidad sin aumentar la concentración de sustrato o enzimas se van a seguir una serie de estrategias:


  • Agrupar todos enzimas de un sistema multienzimático en un complejo multienzimático. De esta forma, el producto es transferido directamente al siguiente enzima, de manera que en el complejo entra, por ejemplo, un sustrato A y sale directamente el sustrato I. La velocidad total no estará influenciada por la velocidad de difusión, aumentando la eficacia.

  • Encerrar todos los enzimas y sustratos o metabolitos intermediarios de la ruta en un compartimento.

  • El complejo multienzimático se encuentra incluido en una membrana. Se reduce la difusión de un espacio tridimensional a un espacio bidimensional. La probabilidad de que el sustrato y el enzima se encuentren es mucho mayor en dos dimensiones que en tres dimensiones.