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lunes, 16 de septiembre de 2019

Nuevos Apuntes y Materiales

He abierto en las páginas de apuntes y de presentaciones una nueva serie de materiales para la Biología de Segundo de Bachillerato.

De momento encontramos la primera parte del tema de biología molecular. El material irá siendo completado, para posteriormente añadir nuevos temas adaptados al actual currículo.

Dejo el enlace directo:

Apuntes: Biología Molecular. 

Presentaciones: Biología Molecular.

He usado materiales creative commons y como siempre, al carecer de ánimo de lucro, pueden ser descargados, usados o modificados a gusto de quien quiera hacer uso de los mismos.

domingo, 15 de octubre de 2017

Ácidos Nucleicos: ADN

Características Generales
El ADN, acrónimo de ácido desoxirribonucleico, es probablemente la macromolécula más importante y que mejor caracteriza a los seres vivos. Cada ser vivo tiene su propio ADN. Éste se encarga de codificar la información sobre cómo fabricar todas las proteínas del ser vivo e incorpora los mecanismos que indican cuándo y dónde fabricarlas.
Se trata de una macromolécula extremadamente importante y por esta razón se encuentra confinada en el núcleo celular, condensada formando una especie de ovillo denso y muy largo, denominado cromatina; salvo durante la división celular, momento en el cual debe abandonar el núcleo y condensarse formando unas estructuras denominadas cromosomas, que permiten el reparto equitativo del ADN entre las células hijas.
Estructura del ADN
El ADN es una macromolécula con estructura de doble cadena conformando una doble hélice. Tratemos de explicar detenidamente esta estructura.
Cada cadena de ADN está formado por una sucesión de nuceótidos. Cada nucleótido está constituido por un azúcar de cinco carbonos, en este caso desoxirribosa, unido a una base xántica, que puede ser Adenina, Timina, Citosina o Guanina. 
Las dos cadenas de ADN se encuentran unidas entres sí mediante enlaces débiles que las bases xánticas establecen entre ellas. Es decir, cada base xántica de una de las cadenas se empareja y une mediante un enlace débil a una base xántica de la otra cadena.
Pero esta unión o emparejamiento no tiene lugar de cualquier manera. Las bases se emparejan de solo de una determinada forma y así, si en una cadena tenemos la base xántica Adenina, en la contraria debemos tener una Timina, mientras que si tenemos una Guanina, esta deberá estar emparejada con una Citosina.

domingo, 8 de octubre de 2017

Ácidos Nucleicos: Características Generales

Las macromoléculas son moléculas orgánicas de gran tamaño. Entre las macromoléculas más destacadas encontramos los fosfolípidos, que forman las membranas biológicas, los polisacaridos, que almacenan energía y forman las paredes celulares de las células vegetales, las proteínas, que se definen como el principal componente funcional de los seres vivos y los ácidos nucleicos.
Los ácidos nucleicos son una familia de macromoléculas encargadas de codificar, preservar, transmitir y reproducir toda la información referida al funcionamiento del ser vivo.
Dentro de los ácidos nucleicos encontramos el código y las claves que indican al resto de componentes celulares qué proteínas deben ser fabricadas, cómo y cuando. Condicionan la herencia, la transmisión de caracteres desde los progenitores a los descendientes. Y los cambios accidentales en sus secuencias son responsables de trastornos y enfermedades, como el cáncer, pero también son responsables de los cambios y de la evolución, es decir, de la transformación de los individuos y de la aparición de nuevas especies.
Estructura General de los Ácidos Nucleicos
Los ácidos nucleicos son cadenas lineales, no ramificadas y poliméricas, es decir, formadas por su unidades o estructuras más simples repetidas. Cada una de las subunidades son denominadas nucleótidos. 
Cada nucleótido está compuesto por un azúcar, variable dependiendo del ácido nucleico y por una molécula orgánica compleja perteneciente a una familia de compuestos denominados báses xanticas. Hay cinco bases xánticas diferentes: Adenina (A), Citosina (C), Timina (T), Guanina (G) y Uracilo (U).

La cadena se forma por la unión de los azúcares entre sí. Los ácidos nucleicos pueden estar formados por miles e incluso millones de nucleótidos dispuestos sucesivamente.

Existen dos grandes tipos de ácidos nucleicos: el ácido desoxirribonucleico (ADN) y el ácido ribonucléico (ARN).

sábado, 2 de marzo de 2013

La célula vegetal.


Introducción.

Todas las células vegetales presentan una pared celular rígida, además d euna familia de orgánulos propios, denominados plastos o plastidios (entre los que encontramos los cloroplastos). Por otro lado, tiene otro orgánulo específico, llamado vacuola vegetal y que resulta una especie de almacén celular. Carecen de centiolos ni estructura derivadas, como cilios o flagelos.

Estas son las principales características que diferencian las células animales de la vegetales.

Pared celular.

En los tejidos no todo el espacio está ocupado por células. Hay un medio externo. En la parte inferior de muchos tejidos tanto animales como vegetales existe una membrana, compuesta fundamentalmente por proteínas y que se denomina lámina basal.

La pared celular de vegetales es algo similar, pero de mayor tamaño y la rodea completamente. Su grosor puede variar desde 0,1μm hasta 10 ó 20μm. No es deformable y hace que las células vegetales sean totalmente inmóviles. No vamos a tener ni células similares a las musculares ni tejidos en general especializados en el movimiento.

La pared celular presenta una estructura con tres estratos. El primero se denomina lámina media, la segunda se denomina pared primaria y la tercera la pared secundaria.

La lámina media es compartida por las dos células y constituye su sistema de adhesión. La pared primaria se presenta cuando la célula está creciendo, aumentando su volumen. La pared secundaria es más gruesa y cuando aparece, normalmente, la célula perderá su contenido citoplasmático y su núcleo.
Estructura de la pared celular
Los componentes más antiguos se presentan en la zona periférica. Los más recientes están en estrecha relación con la membrana plasmática.

En la pared secundaria hay tres estratos diferenciados. Del exterior al interior se denominan S1, S2 y S3.

Cada estrato posee una composición química propia. En la pared primaria el componente más habitual es un polisacárido, la celulosa. Son cadenas de glucosa unidas por enlaces β1-4 (otros polisacáridos, como el almidón, son cadenas de glucosas unidas por enlaces α1-4 y en estos enlaces radica la diferencia que hace que no podamos digerir madera, mientras que los rumiantes sí pueden, pues estos poseen en su estómago protozoos con enzimas capaces de romper los enlaces de la celulosa). Se trata de una cadena lineal sin ramificaciones. Se establecen puentes de hidrógeno entre cadenas paralelas. Con esto se consiguen haces muy gruesos y resistentes, siguiendo una determinada pauta.

La pauta es la siguiente: 32 cadenas de celulosa se asocian por puentes dehidrógeno y se va formando lo que se llama una fibrilla elemental. 20 fibrillas elementales se asocian para dar lugar a una microfibrilla. 200 microfibrillas se asocian para dar lugar a una fibrilla. Y 2500 fibrillas se asocian y dan lugar a una fibra de celulosa.

En la pared primaria toda la celulosa está en forma de microfibrilla. En la pared secundaria estará en forma de fibrillas o de fibras de celulosa.

La celulosa no es el único componente de las paredes. Otro componente típico son las hemicelulosas. Son polímeros de celulosa. En ellas encontramos uniones β1-4, pero son moléculas muy cortas y con ramificaciones. Se asocian a las fibras de celulosa.
Celulosa y hemicelulosa
Las pectinas so polímeros de hidratos de carbono, ramificados y localizados en los espacios intermedios entre las fibras de celulosa. Se unen a las porciones libres de la hemicelulosa. De esta manera, las microfibrillas de celulosa se unen gracias a la hemicelulosa.

Las glucoproteínas aparecen a concentraciones más bajas. Son proteínas ricas en aminoácidos de serina, treonina e hidroxiprolina, es decir, con grupos hidroxilo libres.
Celulosa, Hemicelulosa y Pectinas
Las ligninas son moléculas derivadas del fenol. Se trata de polímeros formados por la unión de alcoholes fenólicos, principalmente alcohol coumarílico, coniferílico y sinepílico.
Ligninas
Se trata de compuestos químicos muy hidrófobos. La lignina es exclusiva de paredes secundarias. Impermeabiliza la pared. Esto supone matar a las células y por eso la lignina es propia de células en las que ya no hay citoplasma ni núcleo.
Estructura tridimensional de la pared primaria

     Génesis de la pared.

Las hemicelulosas y pectinas se sintetizan en el aparato de Golgi. Estos compuestos no requieren de una secuencia específica de azúcares; en cambio, las glucoproteínas sí requieren de una secuencia específica. Esto significa que para su generación sólo se necesita un tipo de enzimas: los enzimas que catalizan la formación de cadenas de glucosa con enlaces β1-4. Son proteínas integrales de membrana. Van al aparato de Golgi y de ahí salen en vesículas hacia la zona donde estará la lámina media.
Génesis de la pared
Estas vesículas, que constituyen lo que se denomina fragmentoplasto, comienzan a unirse entre si. Se van fusionando y en este proceso, se va formando la membrana intermedia. Lo que está en el interior de las vesículas formará el componente del espacio intermembrana.

Las vesículas, que vienen del aparato de Golgi, tienen pectinas y hemicelulosas. Van a formar una pared muy rica en pectinas, constituyendo lo que será la lámina media entre ambas células. Su función es mantener las células unidas, pegadas.

La membrana plasmática tiene una serie de proteínas de membrana con los componentes necesarios para formar la celulosa. Las vesículas provenientes del Golgi comienzan después a aportar materiales necesarios para fabricar la celulosa.

Del aparato de Golgi provienen vesículas con los materiales necesarios. Hay un vertido de cadenas lineales de celulosa. Las cadenas de celulosa se van asociando en el exterior. En un primer momento, las cadenas pequeñas, constituidas por microfibrillas, se asocian de una forma bastante azarosa. Dan lugar a una estructura anisótropa, formando una especie de pared formada por agujas sin orientación alguna. Esta estructura constituye la pared primaria.

Si la célula es de una zona que requiere actividad citoplasmática, como una hoja, esta será la única pared que aparecerá. Pero si la función del tejido es, por ejemplo, mantener erguida la planta, las células perderán su citoplasma en su estado más adulto.

Este proceso se debe a la acumulación en la pared de un aporte de material de forma continua. La celulosa comienza a estar constituida por muchas menos cadenas de celulosa, pero mucho más largas. Se formarán fibras de celulosa. Estas no se pueden entrelazar si se disponen al azar y por eso comenzarán a tomar una estructura espacial preferente. Se orientan de una forma mucho más ordenada.
La pared secundaria presentará por este motivo un aspecto fibroso. También presentará entre sus componentes pectinas y otros componentes. Finalmente comenzará el aporte de lignina. Esta no proviene del aparato de Golgi, sino de lisosomas y de algunas derivaciones de las vacuolas. La lignina impermeabilizará la estructura.

La pared celular funcionará ahora como una barrera de permeabilidad. Esto es algo secundario, las moléculas de gran tamaño no la pueden atravesar, las de pequeño tamaño sí. No obstante, se trata de una pared muy rígida. Actuará como un exoesqueleto, es decir, como un esqueleto externo.
Las concentraciones salinas interiores de la célula son mucho mayores que las exteriores en las células vegetales. El agua tiene tendencia a entrar en grandes cantidades. La célula no aumenta de volumen y explota gracias a la pared. Si quitásemos la pared, la célula aumentaría de volumen hasta explotar.
Por este motivo la membrana plasmática está pegada a la pared, ejerciendo sobre ella una presión. Se denomina presión de turgencia o turgar. Esa presión será la responsable de guiar el crecimiento y los posibles movimientos de las células vegetales.

El turgor controla el tamaño y la forma de la célula. Si la pared fuese homogénea, la célula tendería a adquirir una forma esférica. En determinadas zonas, en cambio, hay partes más rígidas, mientras que otras partes son menos rígidas. Esto marcará las zonas de crecimiento de la célula vegetal.
Zonas de crecimiento de la pared
Una gran parte de las características de la célula vegetal vendrán determinadas por la pared celular. En algunos estudios solo se analiza la pared celular. Para aislarla introducimos el tejido en hipoclorito y así se elimina el citoplasma.

La presión de turgencia es muy importante. En algunas células puede llegar a las 50 atmósferas.

     Incorporación de nuevos materiales.

Se han descrito cuatro posibles mecanismos para incorporar nuevos materiales:
  • Aposición.
  • Intususpección.
  • En mosáico.
  • Multirreticular.

La aposición propone que los materiales se superpondrían a los ya existentes, sin unirse a los anteriores y formando capas nuevas, que empujan a las otras a partes exteriores.

La intususpección consiste en que los materiales no quedan alineados o formando una capa, sino que se acoplan parcialmente a la capa ya formada. Los materiales nuevos y ya formados se unen y reorganizan.

El mecanismo en mosáico propone que en determinadas ocasiones hay una desordenación parcial de la pared y se podrían, en determinadas regiones, generar una ruptura. Es en estos huecos donde se añaden nuevos materiales.

En el mecanismo multirreticular los materiales ya existentes tienen capacidad de reorganizarse. Debido a la presión de turgencia, se produce reorganización, los componentes se colocan de forma más paralela. La organización ocuparía un volumen menor, los materiales nuevos no están orientados por lo que ocupan más volumen. Debido a la presión de turgencia estos se volvería a organizar y ocupar menos volumen dejando huco para nuevos materiales.

No está claro qué mecanismo se cumple, en algunas células parece que uno y en otras parece que otro. Los dos primeros son los principales, los dos últimos no dejan de ser variaciones de los dos primeros.

Las paredes de las células vegetales presentan discontinuidades, interrupciones. Se denominan punteaduras. Hay punteaduras primarias o primordiales en la pared primaria y sencundarias o punteaduras sin más en la pared secundaria.

Las punteaduras primarias son mucho más pequeñas y se descubrieron más tarde. Son muy importantes y están relacionadas con los plasmodesmos. Las células con solo pared primaria solo tendrán punteaduras primarias.

Las punteaduras son huecos y no deben confundirse con los plasmodesmos. En los plasmodesmos existe una continuidad de las dos membranas, los citoplasmas están unidos. El plasmodesmo está ocupado por una estructura en forma de i mayúscula, que forma lo que se denomina desmotúbulo. El desmotúbulo se continúa con el retículo endoplásmico rugoso.

La punteadura supone una continuidad física entre las células y supone un paso sin control de sustancias a ambos lados de las células. En cambio, en el plasmodesmo hay un control de paso a través del desmotúbulo, se trata de una unión más específica, solo pasan algunas moléculas.
Punteaduras y plasmodesmos
El desmotúbulo puede variar su diámetro. Cuanto mayor sea el desmotúbulo, mayor control del paso de sustancias, ya que por los lados dejará menos espacio de citoplasma para el paso libre de sustancias. A través del desmotúbulo pasan multitud de sustancias. Pueden pasar incluso partículas virales. Es un paso mucho más ancho que, por ejemplo, las uniones Gap.

Todas las células con protoplasto tienen este tipo de estrucuturas, en algunos tipos celulares pueden ser especialmente abundantes. Todas las cavidades internas de las células vegetales están, por lo tanto, unidas.

Debido a esto se habla de simplasto, cuando nos referimos a la cavidad formada por todas las células. Un producto químico puede pasar de una célula a otra muy alejada sin salirse del citoplasma.

Nos referimos al apoplasto cuando hablamos de la cavidad formada por el exterior de todas las células vegetales, sin tner en cuenta el interior.

Hay zonas con muchas punteaduras primarias y se habla de campos de punteaduras.

Las punteaduras secundarias o punteaduras propiamente dichas, suelen darse entre células sin protoplasto. En este caso aperecerá una membrana de la punteadura o membrana de cierre, que es la zona de pared primaria y lámina media que está en la zona de la punteadura. Al espacio abierto en la pared secundaria se le denoimina cavidad de la punteadura. El hueco en sí mismo es la punteadura secundaria. Las punteaduras secundarias pueden ser simples o aeroladas. Y dentro de cada uno, podemos encontrar punteaduras dobles (normales)  o unilaterales.

Comencemos con la estructura de una punteadura simple:
Punteadura simple
En las punteaduras aeroladas hay una cavidad, la pared secundaria se eleva y se produce, de esta forma, un redoble. Como indicábamos, estas pueden ser también unilaterales o dobles. El espacio que queda bajo la elevación se le denomina cavidad de la punteadura y al canal, poro de la punteadura.
Punteadura aerolada
Debemos tener en cuenta que estos dibujos son esquemáticos, pues realmente la pared secundaria es mucho más gruesa que la primera, que actuaría como membrana de cierre.

Es habitual que en estas punteaduras aeroladas exista un engrosamiento de ma membrana de cierre. Se le denomina Toro. Funciona a modo de válvula, sube y baja ante diferencias de presión. Se trata de una región impermeable. Al deformarse, subir y bajar tapa el poro, obliterando el orificio o canal de la punteadura. De este modo se controla el paso del agua de célula a célula.
Punteadura aerolada con toro
Los plasmodesmos se originan durante el primer estadío de formación de la pared. En determinados puntos, la fusión de las vesículas tras la mitosis deja huecos, pudiendo observarse que determinados elementos del retículo endoplasmatico se van quedando en el medio, formando la esturctura que será el desmotúbulo.

Plastidios.

En las células vegetales hay un orgánulo denominado plastidio o plasto. Se trata realmente de un conjunto o familia de orgánulos con doble membrana. Poseen genomia propio, ADN, e incluso ribosomas propios específicos, resultando de esta forma que actúan como orgánulos semiautónomos. Todos provienen de un mismo origen, de un protoplasmidio.

Dentro del concepto de plastidio hay varios tipos, pudiendo hablar de cloroplastos, cromoplastos y leucoplastos.

Los cloroplastos tienen pigmentos tipo clorofila y en ellos se realiza la fotosíntesis.
Los cromoplastos son plastos parecidos a los cloroplastos, pero con otros pigmentos. Usan longitudes de onda diferentes.

Los leucoplastos no tienen color, no poseen pigmentos. Tienen funciones de reserva, es decir, de almacenamiento. Pueden almacenar almidón y hablamos de amiloplastos, o proteínas y hablamos de proteoplastos. Cuando acumulan lípidos se les denomina oleoplastos.

Que el protoplastidio vaya a formar uno u otro tipo de plasto depende de los primeros estadíos de formación, de los primeros pasos. Hay una cierta posibilidad de interconversión.

Por ejemplo, as patatas poseen gran cantidad de amiloplastos. Al ponerlos al sol, transformarse en cloroplastos y la patata adquirirá coloraciones verdosas.
Los plastidios son orgánulos con una cierta independencia, pues por ejemplo son capaces de dividirse de manera autónoma.

     Cloroplastos.

Cloroplasto
Los cloroplastos presentan una estructura características, con una membrana plastidial externa y una membrana interna. En los cloroplastos la membrana interna no tiene invaginaciones (como ocurre con las mitocondrias), son lisas. Dentro hay unas membranas que forman una especie de láminas aplanadas, acumulándose en forma de sacos alargados. A cada estructura se le llma tilacoide. Al conjunto de tilacoides se denomina granos o grana.

El DNA es una molécula circular, pequeña. Presenta un número alto de copias de, entre 5 y 15 aunque este número varía bastante. Suele presentar una zona de unión con la membrana interna.

La clorofila y sus proteínas se encuentran en la membrana de los tilacoides, donde fomran una especie de granos.

Es en esta zona donde se realizará el proceso de fotosíntesis. La reacción global de la fotosíntesis se puede resumir de la siguiente forma:

Se pueden distinguir dos etapas, una en la que la célula obtiene enrgía gracias a la luz, acumulándola en forma de ATP y NADPH, y una segunda en la que, a partir de ese ATP y NADPH, da lugar mediante una serie de reacciones , a la formación de componentes ricos en energía (glucosa, azúcares, etc.).

La primera reacción de la fotosíntesis ocurre en las membranas tilacoidales. El segundo paso se incia en el estroma de los cloroplastos y se completa en el citoplasma de la célula.

Encontramos dos fotosistemas, el I y el II. El fotosistema II obtiene la energía de la luz a 680nm, mientras que el fotosistema I obtiene energía de la luz a 700nm. En la caída de energía de los electrones se bombean al espacio intermembrana, como en la mitocondria. El flujo de electrones se usa para obtener moléculas energéticas.
Fotosistemas
Una vez se ha obtenido esa energía, la primera reacción consiste en que una molécula de dióxido de carbono se une a una molécula de ribosa (ribulosa 1, 5 difosfato).
Reacción de la ribulosa 1, 5 difosfato carboxilasa
La ribulosa 1,5 bifosfato carboxilasa cataliza la primera reacción y se considera el enzima más abundante de la Tierra. El proceso es lento, con unas tres moléculas por segundo. Por eso debe haber muchas moléculas de enzima. Supone alrededor del 50% del contenido del estroma del cloroplasto. Está constituido por varias cadenas polipeptídicas. La mayor de ellas está codificada por el ADN propio del cloroplasto.

Cloroplasto inactivo
Los ribosomas del colorplastos presentan índices de sedimentación 60S. Se asemejan mucho al de los procariotas (una prueba más del origen simbionte de estos orgánulos). Y el ADN se transmite solo desde la parte femenina de la planta (como ocurre con las mitocondrias).

El funcionamiento es diferente cuando hay y cuando no hay luz. Cuando no hay luz, el cloroplasto no solo no funciona, sino que además varía su morfología. Adquieren una morfología característica y se les denomina etioplastos. También presentan alteraciones bioquímicas, bajando los niveles de algunos enzimas como el 1,5 BP Carboxilasa.  Se trata de un proceso reversible, recuperando los pigmentos y niveles enzimáticos cuando la luz aumenta.

La vacuola vegetal.

Es un orgánuylo muy espcífico, que no se parece en nada a las vacuolas animales. Almacenan productos ricos en energía, agua, sales minerales, etc. Pueden ocupar mucho volumen dentro de la célula. De hecho, en algunos casos contribuyen a que el volumen de la célula sea grande. Esto es importante en células fotosintéticas, ya que a mayor volumen, mayor exposición a la luz.

Presentan una membrana denominada tonoplasto. Se trata de una membrana con muchas proteínas de transporte específicas. Se cree que deriva del aparato de Golgi.

El proceso de formación de las vacuolas recuerda al proceso de formación de los lisosomas. Del aparato de Golgi salen vesículas marcadas que llegan a la membrana de la vacuola. La membran de la vesícula se incorpora de esta manera a la membrana vacuolar.

Los carbohidratos que acumulan suelen ser polímeros, como el almidón. Es importante en el proceso de regulación de la presión de turgencia. El almidón, en estado polimérico, es una molécula osmóticamente inactiva. Pero la glucosa sí que es activa. La despolimerización del almidón es importante para controlar esta presión osmótica, por lo tanto. Al despolimerizarse el almidón, aumentamos la presión de turgencia.

La vacuola no está relacionada con la expulsión de materiales al exterior, sino para la acumulación de materiales en el interior.

Ausencia de centrilos.

Las células de vegetales claras, evolucionadas, es decir, a partir de algas. La ausencia de centriolos implica que las células, normalmente, no son móviles, les falta un sistema para remover el medio. También implica diferencias en cuanto al citoesqueleto. En las células animales, el aparato de Golgi está formado por sáculos que se separan unos de otros y se mantienen en esa posición gracias al citoesqueleto, por ejemplo (de este modo, si añadimos una sustancia que desorganice los microtúbulos, el aparato de Golgi desaparece). En las vegetales hay moléculas de unión intercisternar, es decir, poseen un sistema de anclaje diferente.
En la división celular no hay un estrangulamiento, sino que se forma un fragmentoplasto, a partir de vesículas fabricadas en el aparato de Golgi. Por lo que no hace falta organización de citoesqueleto.

Metabolismo secundario.

Las células vegetales tienen metabolismo secundario. Consiste en reacciones de síntesis de productos que, en muchas ocasiones, no se conoce su función, como alcaloides, etc. (por ejemplo, el caucho). En ocasiones son productos de desecho, en otras feromonas.

Aparecen en el citoplasma en forma de inclusiones de diversa naturaleza. Las células animales, en ocasiones, también tienen inclusiones, aunque no son tan frecuentes ni abundantes.
Esquema de una célula vegetal

martes, 30 de octubre de 2012

Virus: morfología y metabolismo básicos.

Los virus son parásitos obligados de células vivas. Para ser capaces de reproducirse, necesitan estar dentro de una célula viva. Esta célula es específica. Todo virus puede pasar por dos estados: el extracelular y el intracelular (fuera o dentro del huésped respectivamente). Solo cuando está dentro es capaz de dirigir un metabolismo.

Virus de la gripe.
Su estructura se conoce como virión. El virión tiene un tamaño de entre 0,03 y 0,3μm. Por lo tanto, solo son detectables con el microscopio electrónico. Tienen un ácido nucleico, una cápside o cubierta y en algunos casos una envoltura.

Su ácido nucleico puede ser ADN o ARN, pero nunca los dos. Tanto en un caso como en el otro, puede ser mono o bicatenario. Puede ser lineal, es decir, con los cabos libres, o circular. Protegiendo a este ADN está la cápside o cubierta protéica. Está formada por uno o varios tipos de subunidades que se depositan, llamados capsómeros. Si son iguales, ahorrará una gran cantidad de información acumulada (si solo es una proteína, solo se necesita un gen para formar la cubierta). Puede tener proteínas auxiliares o enzimas (para entrar en el huésped, por ejemplo).


Además del ácido nucléico y la cápside, puede tener una envoltura, una bicapa lipídica con sus proteínas, normalmente glicoproteínas. Los glucolípidos son idénticos a los de la célula huésped, son los de la célula del huésped que toma al salir. Las proteínas en cambio son específicas del virus, se forman con la información del virus.
Estructura de virus.
Según el tipo de cápside hay varios tipos de virus.

Los capsómeros pueden formar agrupaciones geométricas: poliédrico, más o menos esférico o helicoidalmente, dando lugar a una forma tubular o una combinación de ambos tipos de simetría.

Los capsóemeros se unen formando una geometría ecosonoédrica, es decir, dando lugar a un ecosonaedro. Un ejemplo son los adenovirus, que posee 252 capsómeros tomando esta forma. Hay dos tipos de capsómeros, los de los vértices y los de las caras:
Adenovirus.
 Hay virus que siguen una geometría helicoidal. Como por ejemplo el TMV, el virus del mosaico del tabaco. Está formado por capsómeros colocados de forma helicoidal, formando un tubo. El capsómero tiene forma más o menos cúbica y hay 16,3 capsómeros por vuelta. El ADN está “pellizcado” en la hendidura de la espiral.
Virus del mosaico del tabaco.
Existen virus que son una combinación de estos dos tipos, tienen una cápside geométrica y una zona helicoidal. Por ejemplo, los fagos de la serie T. Se trata de parásitos de Escherichia coli. Hay siete tipos diferentes de fagos de la serie T (nombrados de T1 a T7). Fago es la abreviatura de la palabra “bacteriófago”.
Fago de la serie T.
 Muchos de los virus icosaédricos poseen envoltura.

Fase vegetativa de los virus.

El material genético de los virus tiene información para todos los capsómeros, suele tener también información para algún enzima calve. Pero en general no tiene nada de información para multitud de cosas que necesita para replicarse.

Desde que el virus entra hasta que salen los viriones se le llama infección viral. Se puede llevar a cabo de maneras diferentes. Es lo que se denomina ciclo lítico.
Ciclo Lítico.

Durante el ciclo lítico el virus se reproduce, pero con muerte de la célula huésped. Vamos a verlo en el caso de los fagos de la clase T. Dentro de los fagos, cuando solo pueden realizar el ciclo lítico, se les conoce como fagos virulentos (su única opción es acabar matando la célula).

Veamos las fases.

La primera fase es la adsorción y fijación a una bacteria. Es específica, hay un reconocimiento específico. En la membrana de la célula, habrá algunos componentes que se unirán a la cola del virus. Este debe hacer actuar, tras la unión, a la lisozima. La lisozima es un enzima de la cola que ataca a la pared de la bacteria, rompiendo enlaces  glicosídicos y debilitando esta parte.
Fase de fijación.
 La segunda fase es la fase de inyección de ADN. El eje tubular se clava en la pared celular (que previamente había sido debilitada).
Fase de inyección.
 La tercera fase se denomina fase de eclipse. Durante esta no se ve ninguna cápside. El material genético se expresa dentro de la célula. Utiliza la maquinaria de la célula y sus materias primas. No se expresa de golpe, se expresa en un orden determinado. Se expresan tres bloques de genes.

Primero, los genes tempranos, que van a dar lugar a las proteínas precoces del virus. El DN se transcribe y da lugar al ARN viral. Usa los ribosomas y demás maquinaria de la bacteria. Las proteínas precoces formadas inactivan e inutilizan el ADN bacteriano para que la maquinaria trabaje solo con el virus.
Traducción de genes tempranos.
Después se expresan los genes del metabolismo del ADN. Da lugar, por un lado, a una DNA-asa vírica, una enzima que se encargará de hidrolizar el ADN de la bacteria, pero que no hidrolizará al DNA vírico. De este modo, se destruirá el ADN bacteriano. Se producirán también enzimas de replicación para el ADN viral.

Por último se expresarán los genes tardíos, que dan lunar a la formación del resto de proteínas virales, las que formarán el virión y algunas proteínas auxiliares importantes, también víricas.
Traducción de virus tardíos y replicación del ADN
La siguiente fase es la fase de ensamblaje. Se empiezan a detectar los primeros viriones hijos. Esto es entre los 10 y 20 minutos siguientes desde la entrada del fago. Es un proceso espontáneo de las distintas piezas del virión, por reconocimiento estereoepecífico entre las diferentes partes. Sigue un orden. Lo normal es que se forme por un lado la cabeza, por otro las colas y por otro las fibras. Posteriormente se van uniendo. A la cabeza se une el ADN. A la cabeza se une la cola y por último las fibras.

En este proceso intervienen las proteínas de andamiaje y las enzimas auxiliares. Son proteínas víricas necesarias para formar el virión, pero que no forman parte del virión. Hacen de andamios, sirven de moldes temporales. Las enzimas auxiliares hidrolizan algunos enlaces, etc. Pero después tampoco formarán parte del virión.

El virus no crece, se forma o no se forma. Solo posee multiplicación, pero no crecimiento.

Por último tiene lugar la fase de liberación. Conduce a la lisis de la célula huésped. Salen como entraron, ayudándose del enzima lisozima. Como ahora son tantos, entre 200 y 250 viriones hijos, destrozan lo que quedaba de la bacteria. La pared bacteriana se destruye. Al proceso se le denomina lisis bacterial. La célula muere. Y de este modo concluye el ciclo lítico de la bacteria.
Los virus que atacan a las células eucariotas poseen una fase vegetativa que no mata forzosamente al huésped. El virus puede entrar, multiplicarse y salir sin matar al huésped.

Lisogenia.

Es llevada a cabo por fagos atenuados o lisogénicos. Cuando infectan a una bacteria pueden desarrollar el ciclo lítico o usar la vía lisogénica.

En la ruta o vía lisogénica el ADN vírico se integra covalentemente en un punto fijo o punto de inserción en el cromosoma bacteriano. En este caso se habla de provirus o, en el caso de virus bacterianos, profago. A la bacteria con el ADN vírico insertado se le denomina bacteria lisogénica. El virus está en estado latente. Prácticamente no se expresa. Cuando la bacteria se duplica, el ADN se replica y las células hijas reciben al profago.
Primeras fases de la lisogenia.
Tras unas cuantas generaciones, con una frecuencia muy baja (alrededor de una por cada millón) el profago se separa del cromosoma bacteriano y entra en ciclo vírico o fase vegetativa.

Esta lisis sucede espontáneamente, pero también se puede hacer que la lisis se provoque. Por ejemplo, con luz ultravioleta.

Un ejemplo de virus de este tipo es el fago λ, que ataca a las Escherichia coli de la cepa K 12 (λ).

Si la bacteria tiene un profago, tiene inmunidad sobre otros fagos de esa especie y sobre algunos afines.

La lisogenia no se da solo en bacterias. El virus del Herpes simple, por ejemplo, que suele aparecer con catarros y provocar fiebres, es un ejemplo de virus lisogénico de eucariotas.
¿Por qué sigue la vía lisogénica o el ciclo lítico? Cuando el ADN de un fago como el del fago λ entra en la bacteria, se encuentra en forma lineal, pero tiene los extremos cohesivos, es decir, tiene unos tramos al final que son monohebra y complementarios con los del otro lado.
ADN del Fago (liean y ciclado).
Cuando se forman las proteínas precoces es cuando va a decidir el camino. El sistema de regulación es muy complicado. En esencia, se debe a dos proteínas reguladoras, la proteína Cro y el represor o proteína represora λ (en realidad son tres proteínas). Cada una inhibe la formación de la otra. Solo hay dos situaciones estables.

Cuando predomina la proteína Cro, en cuyo caso comenzará el ciclo lítico. Esto puede suceder cuando el fago acaba de entrar o bien indirectamente en una bacteria lisogenizada, en la que se rompa el equilibrio, cuando el profago se separa.

Si domina la proteína represora λ la proteína Cro no se va a sintetizar. El represor λ impide la transcripción de prácticamente todos los genes del virus. Solo se transcriben los represores y las proteínas que permiten la integración.

Si el equilibrio se desplaza hacia la proteína represora y se establecerán, por lo tanto, las relaciones lisogénicas.
Inserción del ADN vírico en el ADN bacteriano.
El ADN del virus se integra entre dos operones, ente dos genes relacionados con una vía metabólica. Para la integración se necesitan un conjunto de proteínas que formarán un complejo denominado Integrasa. Se integra en un sitio y solo en uno. El ADN del virus se rompe por un sitio específico. La integrasa rompe las dos hebras de ADN y las une.

Se sabe que el estado fisiológico de la bacteria influye sobre si se va a liberar o no el profago. No se sabe bien como. Si sucediera, el complejo escisionasa + integrasa provocaría la liberación del fago. Deben actuar ambos enzimas, ya que la escisionasa por si misma no reconoce la parte del ADN por la que debe cortar.

El que se siga un camino u otro no es cuestión de azar. Existe alguna razón, aunque no se conoce muy bien. Cuando un cultivo es joven y se reproduce rápido, la relación lisogénica se mantiene estable. Si las bacterias envejecen o se reproducen a menor ritmo, facilitan que se rompan las relaciones lisogénicas.

Estos fagos lisogénicos intervienen en el fenómeno de la transducción, que es uno de los mecanismos de la replicación.

La transducción es el paso de material genético de una bacteria a otra sin que se haya producido contacto. Se lleva a cabo por medio de un fago atenuado.

Supongamos que tenemos un fago λ en una relación de lisogenia. Cuando se produce la escisión para liberarse, por error puede llevar parte del material genético de la bacteria. Hay una liberación errónea y se formará un fago λ con un gen que no tenía antes.

Trasducción.
No es forzoso que el fago pierda parte de su información. Puede coger su ADN y algún gen de la bacteria sin necesidad de soltar parte de sus genes.

Cuando finaliza el ciclo lítico, tendremos algunos viriones de fago λ bio + que tendrán genes de más. Al infectar nuevas bacterias, si esta bacteria receptora no tenía la capacidad que codifica el gen (el gen bio en este caso), ahora adquirirá esa capacidad, adquirirá este nuevo gen.
Transición especializada.
Esto se denomina transición especializada, ya que los genes que se transducen son siempre los mismos, es decir, los próximos a los puntos de inserción. Tanto la bacteria dadora como la aceptora tendrían que mantener relaciones lisogénicas con el fago.

Hay otro tipo de transducción, la generalizada. En esta, se transduce cualquier gen de la bacteria dadora. La dadora no puede ser lisogénica, la aceptora si. La bacteria dadora no mantiene relaciones lisogénicas, solo ciclo lítico. Pero durante este ciclo lítico, por error, algún virión adquiere genes del ADN bacteriano y se lo lleva a otra bacteria, la aceptora, con la que mantendrá relaciones lisogénicas.

Virus con ARN.

Tienen que resolver cómo replicarse por si mismos. Las células huéspedes no tienen enzimas capaces de replicar el ARN. Según el tipo de ARN, cómo se lleve a cabo la síntesis del mensajero, cómo se replica el material, va a haber tres tipos de virus con ARN:

  • ARN (+).
  • ARN (-).
  • ARN (±).
Se entiende como hebra positiva aquella que puede ser un ARN mensajero. Su complementaria es la hebra negativa. Cuando se complementa con un ADN también se considera hebra negativa.

Los cuatro tipos de virus pueden tomar dos estrategias, o bien usar una ARN replicasa o bien usar la transcriptasa inversa. El virus debe poseer la información para seguir por uno de estos dos caminos.

Virus con ARN replicasa.

Los hay de los tres tipos. La ARN replicasa es una ARN polimerasa ARN dependiente. Es decir, sintetiza un polímero de ARN, siempre en la dirección 5’3’ complementaria a una hebra patrón de ARN.

Son específicas respecto al ARN patrón que replican, replican los ARN víricos. Los virus solo la usan, por lo tanto, para replicarse a si mismos. Un ejemplo, el virus de la polio. Este es un virus con RNA +. Como puede actuar como mensajero, irá directamente a los ribosomas. Lo primero que hará es sintetizar la RNA replicasa.
Virus con ARN replicasa
En resumen, la hebra + sirve de mensajero para sintetizar la ARN replicasa y de molde para fabricar los ARN  -. Posteriormente los ARN – servirán de molde para fabricar multitud de hebras de ARN + que se usaran como mensajeros para sintetizar las proteínas víricas y que además serán las que se empaquetarán con estas proteínas.

Es decir, tras la traducción se produce el ensamblaje y la salida del virus de la célula.

En el caso de los virus con ARN – como por ejemplo el virus de la gripe, el virión debe llevar dentro la ARN replicasa, ya que el ARN – no puede actuar como mensajero.
Virus con ARN-
En cuanto a los virus de ARN de doble hebra, es decir, ARN ±, una vez ha entrado en la célula se obtendrán, en un principio, solo copias de la hebra +, usando como molde la hebra -. De este modo, el ARN + se usa como mensajero para la traducción de proteínas víricas y posteriormente como molde para obtener las hebras de ARN -. Cuando se complete, el ARN + y el ARN – formarán hebras dúplex y se producirá el ensamblaje.
Virus con ARN +/-

Retrovirus: virus con transcriptasa inversa.

El resto de virus con ARN son los retrovirus, que tienen transcriptasa inversa. El ARN debe ser transformado en ADN. Todos los virus de este tipo poseen una hebra monocatenaria de ARN +.

El enzima transcriptasa inversa suele ir ya fabricado dentro del virión y hace tres acciones seguidas:
Virus con transcriptasa reversa o inversa.

  1. Sintetiza la hebra de ADN – a partir de la hebra de ARN +. Es decir, actúa como ADN polimerasa ARN dependiente.
  2. Hidroliza la hebra de ARN + original que tendría el virión.
  3. Sintetiza el ADN + a partir de la hebra de ADN -. Es decir, actúa como una ADN polimerasa ADN dependiente.
Estas tres acciones son catalizadas por la transcriptasa inversa. En realidad no se trata de un solo enzima, sino de un complejo multienzimático.